Sceneggiatrice e disegnatrice. Nel 1996 ha collaborato con la Walt Disney Company. Tra il 1997 e il 2000 ha creato numerose storie, illustrato tutte le copertine della rivista La Petite Sirène e contribuito a vari progetti originali come character designer; nel 1997 ha ideato, insieme a Elisabetta Gnone e Alessandro Barbucci, l'universo di "W.I.T.C.H." (ambientazioni, personaggi, stile grafico e colori), un progetto che ha dato vita a due serie animate di successo internazionale, oltre a essere stato adattato in formato rivista, diventando il quarto magazine più diffuso al mondo.
Dal 2000 si è dedicata al fumetto, creando insieme ad Alessandro Barbucci l'universo della serie di fantascienza di successo Sky Doll per le Edizioni Soleil, serie pubblicata in tutta Europa, in Cina, Giappone, Corea e negli Stati Uniti, prima da Marvel Comics e poi da Titan Comics. Nel 2003, Barbara Canepa ha sviluppato, con Katja Centomo, Francesco Artibani e Alessandro Barbucci, la serie per ragazzi Monster Allergy, pubblicata da Edizioni Soleil e tradotta in più di dieci paesi stranieri. Grazie a questo successo, la serie è stata adattata in un cartone animato prodotto da DISNEY CHANNEL per l'Europa e da WARNER BROS per gli Stati Uniti, oltre che in un musical rappresentato nei teatri più prestigiosi d'Italia. Nel 2008 è diventata direttrice di collana presso le Edizioni Soleil e ha creato, insieme a Clotilde Vu, Métamorphose e Venusdea. Gran Gunigi come miglior disegnatrice ai Lucca Comics Award nel 2002. Nel 2022 Barbara Canepa ha concluso la sua collaborazione con Edizioni Soleil per fondare, insieme a Mourad Boudjellal, Clotilde Vu e Jean-Luc Istin, una nuova casa editrice, le Éditions Oxymore, all'interno del Gruppo Madrigall, che include anche le Éditions Gallimard, dove lavora come autrice e direttrice di collana. Presenta a Lucca Comics&Games il nuovo volume della serie GreenWood (Tunué) e la nuova collana in uscita nel 2026 Magica, nata da un accordo di collaborazione internazionale Italia-Francia tra Tunué e Editions Oxymore.
Sarà a Lucca dal 30 ottobre al 2 novembre.
